KANDIDAATIN TUTKINTO, 180 op
YLEISOPINNOT, 28 op (sisältää 2 op integroituja opintoja) opintopisteet ajoitus
EYT100 Johdatus tiedeyhteisöön 3 1
sisältää HOPSia (1 op)
sisältää äidinkielen opetusta ja opintoja (1 op)
Y96 Matematiikan tasokoe 1 1
Y100 Matematiikka 1 5 1
YFYS1 Fysiikka 1 5 1
MAA200 Maaperätieteen perusteet 5 1-2
Y130 Tilastollisen päättelyn perusteet 5 2
EYT200 HOPS-tori 1 2
Y10 ATK 2 3 3
PÄÄAINEOPINNOT, 71 op (sisältää 3 op integroituja opintoja)
Perusopinnot, 25 op
MIKRO200 Mikrobiologian peruskurssi 5 1
MIKRO210 Mikrobiologian perusopintoseminaari 5 1
MIKRO220 Mikrobiologian laboratorioharjoitukset 5 1-2
MIKRO231 Elintarvikemikrobiologia 5 2
MIKRO241 Ympäristömikrobiologia 5 3
Aineopinnot, 46 op
MIKRO232 Elintarvikemikrobiologian laboratoriotyöt 5 2
MIKRO242 Ympäristömikrobiologian laboratoriotyöt 5 3
MIKRO401 Mikrobiologin työhön tutustuminen 1 2-3
MIKRO450 Kandidaatin kirjatentti 10 3
MIKRO480 Kandidaatin seminaari 4 3
sisältää 2 op äidinkielen opetusta ja opintoja
sisältää 1 op TVT-opintoja
MIKRO490 Kandidaatintutkielma ja kypsyysnäyte 6 3
Vaihtoehtoisia mikrobiologian, biotekniikan, bioinformatiikan, solubiologian ja genetiikan
teoriaopintojaksoja, esimerkiksi 15 2-3
YBIOT315 Mikrobibiotekniikka, 5 op
Biotieteen perusteet I ja II, 52081 Genetiikan perusteet, 3 op (Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekunta)
54(290) KIELIOPINNOT SEKÄ TIETO- JA VIESTINTÄTEKNIIKAN (TVT) OPINNOT, 10 op
Toinen kotimainen kieli 4 2-3
1. vieras kieli 3 2
TVT-ajokortti 3 1
Tutkintoon sisältyy kieliopintoja yhteensä 10 op:
Toinen kotimainen 4 op
1. vieras kieli 3 op
äidinkielen opintoja 3 op integroituina (1 op EYT100 ja 2 op MIKRO480) Tutkintoon sisältyy TVT-opintoja yhteensä 7 op:
TVT-ajokortti 3 op
Y10 ATK2 3 op
muita TVT-opintoja 1 op integroituina (1 op MIKRO480) MUUT OPINNOT, 15 op
BKEM100 Biokemia I 5 1
BKEM101 Biokemia I harjoitustyöt 5 2
BIOT200 Geenitekniikan perusteet 2 1-2
BIOT201 Geenitekniikan harjoitustyöt 3 2
opintopisteet ajoitus SIVUAINEOPINNOT, vähintään 25 op
Kemian perusopinnot: 25 1-3
YKEM010 Epäorgaaninen ja yleinen kemia, 4 op 1
YKEM020 Orgaanisen kemian perusteet, 4 op 1
YKEM101 Kemian työt, 5 op 1
ja vaihtoehtoisina seuraavista opintojaksoista yhteensä 12 op 2-3
YKEM110 Fysikaalisen kemian luennot, 6 op YKEM111 Fysikaalisen kemian työt, 3 op YKEM200 Soveltava orgaaninen kemia, 6 op YKEM210 Spektrometrian luentokurssi 3 op YKEM220 Kromatografian luentokurssi 3 op YKEM310 Bioepäorgaaninen kemia 3 op
Vapaasti valittava sivuaine1 tai jokin elintarvikealan sivuainekokonaisuus2 25 1-3 VAPAASTI VALITTAVAT OPINNOT
Muita yliopisto-opintoja 6-31
KANDIDAATIN TUTKINTO YHTEENSÄ 180
1Maatalous-metsätieteiden kandidaatiksi (MMK) valmistuvalle suositellaan toista sivuainetta kemian perusopintojen lisäksi. Sivuaine voidaan valita esimerkiksi seuraavista opintokokonaisuuksista: agroekologia, akvaattiset tieteet (esim. limnologia), biokemia ja molekyylibiologia, biotekniikka, ekologia, elintarviketieteet2, geologia, kasvibiologia, kasvintuotannon biologia, maaperä- ja
ympäristötiede, metsäekologia, perinnöllisyystiede, sienitiede, SoilSoc, ympäristöalan monitieteinen sivuaine tai ympäristömuutos ja -politiikka. Sivuainekokonaisuuksien suorittamisesta toisessa tiedekunnassa suositellaan sovittavaksi aina kyseisen oppiaineen vastuuprofessorin, opintoneuvojan tai opintokokonaisuuden vastuuopettajan kanssa.
2Elintarviketieteiden kandidaatintutkinnossa (ETK) pakollinen sivuaine. Valitaan seuraavista opintokokonaisuuksista: elintarviketieteiden perusopinnot (25 op) tai vähintään 25 op sivuainekokonaisuudesta elintarvikekemiassa, ravitsemustieteessä tai
elintarviketeknologiassa.
MAISTERIN TUTKINTO, 120 op
YLEISOPINNOT, 1 op opintopisteet ajoitus
MIKRO501 Maisterin opintojen HOPS 1 4
PÄÄAINEOPINNOT, 88 op
Syventävät opinnot, 88 op
MIKRO510 Mikrobiologian tutkiva työkurssi 17 4
MIKRO560 Mikrobigenetiikka 5 4
Mikrobiologian syventäviä laboratoriotöitä3 5 4-5
MIKRO575 Elintarvike- ja ympäristöhygienia ja valvonta 5 3-5
MIKRO600 Maisterin tutkielma 40 5
MIKRO610 Harjoittelu ja harjoittelukertomus 3 4
MIKRO630 Mikrobiologian seminaari 3 4-5
MIKRO650 Maisterin kirjatentti 10 5
55(290) SIVUAINEOPINNOT, 25 op
Elintarvikealan perusopinnot4 25 3-5
VAPAASTI VALITTAVAT OPINNOT
Vapaasti valittava sivuaine5 tai muita yliopisto-opintoja 6-31 3-5
MAISTERIN TUTKINTO YHTEENSÄ 120
3Valitaan seuraavista mikrobiologian tai biotekniikan syventävistä laboratorio- ja harjoitustyöopintojaksoista: MIKRO520, MYKO540, MIKRO580, MIKRO590, YBIOT565, YBIOT570
4Pakollinen sivuaine elintarviketieteiden maisterintutkinnossa (ETM), ellei elintarvikealan sivuainekokonaisuutta ole suoritettu jo kandidaatin (ETK) tutkinnossa.
5Maatalous-metsätieteiden maisteriksi (MMM) valmistuvalle suositellaan vapaavalintaista1 sivuainetta.
Erikoistuminen
Mikrobiologiassa voi erikoistua elintarvike- tai ympäristömikrobiologiaan tai biotekniikkaan. Erikoistuminen tapahtuu vähintään 25 opintopisteen sivuaineopinnoilla. Sivuaineopinnoista on sovittava henkilökohtaisen opintosuunnitelman (HOPS) laatimisen yhteydessä.
Vapaasti valittaviksi opinnoiksi soveltuvat esim. bioinformatiikan, biokemian, kliinisen mikrobiologian, matematiikan, molekyylibiologian, perinnöllisyystieteen ja yleisen mikrobiologian opinnot ja tiedekunnan yhteiset opintojaksot sekä ylimääräiset kieli- ja viestintäopinnot.
Elintarvikemikrobiologia
Elintarvikemikrobiologiaan erikoistuva ja ETK- tai ETM-tutkintoa suorittava koostaa sivuaineekseen elintarviketieteiden perusopinnot (25 opintopistettä) tai 25 opintopisteen elintarvikekemian, ravitsemustieteen tai elintarviketeknologian sivuainekokonaisuuden sekä valitsee kandidaatin ja/tai maisterin tutkielmansa aiheen elintarvikealalta tai sen lähitieteistä.
Ympäristömikrobiologia
Sivuainekokonaisuus tai sivuaineiden opinnot suositellaan valittaviksi esim. seuraavista: akvaattiset tieteet (esim. limnologia), biokemia ja molekyylibiologia, biotekniikka, ekologia, geologia, kasvibiologia, kasvintuotannon biologia, maaperä- ja ympäristötiede,
metsäekologia, perinnöllisyystiede, sienitiede, SoilSoc, ympäristöalan monitieteinen sivuaine (YMS), ympäristömuutos ja -politiikka.
Opintokokonaisuuden (vähintään 25 op) suorittaminen sivuaineesta on suositeltavaa. Kandidaatin ja maisterin tutkielmien aiheet tulee valita niin, että ne tukevat erikoistumisalaa.
Biotekniikka
Mikrobiologian opiskelijat voivat liittää biotekniikan sivuainekokonaisuuden joko kandidaatin- tai maisterintutkintoonsa riippuen muista pakollisista sivuaineista ja biotekniikassa vaadittavien esitietovaatimuksien täyttymisestä biokemiassa, mikrobiologiassa ja genetiikassa.
Ympäristöbiotekniikan kurssit (YBIOT) löytyvät mikrobiologian opinto-opasteksteistä.
Opintokokonaisuudet 864090 Mikrobiologian perusopinnot 864091 Mikrobiologian aineopinnot 864092 Mikrobiologian syventävät opinnot
Opintokokonaisuudet sivuaineopiskelijoille
Mikrobiologian sivuainekokonaisuus 25 op on vastaava kuin mikrobiologian perusopinnot -opintokokonaisuus. Mikäli sivuaineena suoritettavan mikrobiologian perusopintojen opintojaksoista osa kuuluu opiskelijan muihin opintokokonaisuuksiin, voidaan mikrobiologian perusopintoihin sisällyttää muita mikrobiologian tai mikrobi- ja ympäristöbiotekniikan teoriaopintoja.
Mikrobiologian sivuaineopinnot (25 op)
MIKRO200 Mikrobiologian peruskurssi 5
MIKRO210 Mikrobiologian perusopintoseminaari 5 MIKRO220 Mikrobiologian laboratorioharjoitukset 5
MIKRO231 Elintarvikemikrobiologia5 5
MIKRO241 Ympäristömikrobiologia5 5
5Sivuaineopiskelijatvoivat halutessaan korvata toisen teoriaopintojakson jo suoritettua teoriaopintojaksoa täydentävällä
laboratoriokurssilla MIKRO232 tai MIKRO242. Näille laboratoriotyökursseille osallistumisesta on sovittava erikseen mikrobiologian opintoneuvojan ja oppiainevastaavan professorin kanssa.
Mikrobiologian aineopintojen laajuus sivuaineopiskelijoille on 60 op (sisältäen perusopinnot 25 op). Sivuaineopiskelija ei tällöin tee kandidaatin tutkielmaa (MIKRO490) vaan tekee kandidaatin seminaarissa (MIKRO480) seminaarityön, jolloin kandidaatin seminaarin laajuus on 5 op. Vaihtoehtoisten opintojen laajuus sivuaineopiskelijoiden aineopinnoissa on 12 op. On suositeltavaa, että sivuaineena tehtävistä aineopinnoista laaditaan opintosuunnitelma mikrobiologian opintoneuvojan kanssa. Opintosuunnitelman tarkastaa ja hyväksyy mikrobiologian oppiainevastaava professori.
takaisin ylös
Opintojaksot 2011-2014 (sivut 53-60) Opetustiedot WebOodissa
Lisätietoja. Kaikki mikrobiologian opintojaksoille esivaatimuksina mainitut opintosuoritukset on mahdollista korvata vastaavan sisältöisillä opintojaksoilla tai vastaavilla tiedoilla ja taidoilla. Kursseilla menestyminen edellyttää aktiivista osallistumista luennoille, seminaareihin ja ryhmätöihin. Laboratoriotyökursseilla on läsnäolopakko. Mikrobiologian opintojaksoihin sekä kurssi- ja kirjatentteihin
56(290) ilmoittaudutaan WebOodissa. Laboratoriotyökursseille tulee ilmoittautua viimeistään kaksi viikkoa ennen kurssin alkua.
Laboratoriotyökursseille hyväksytään vain vaaditut opintosuoritukset suorittaneet ja määräaikaan mennessä ilmoittautuneet opiskelijat.
Ensisijaisesti hyväksytään mikrobiologian pääaineopiskelijat, seuraavaksi ne opiskelijat, joille kurssi on muutoin pakollisena tutkintoon, ja kolmanneksi sivuaineopiskelijat, mikäli laboratoriotyöryhmissä on tilaa. Viimeisimmät tiedot annettavasta opetuksesta löytyvät mikrobiologian osaston ilmoitustaululta, WebOodista ja Mikrobiologian opintoneuvonta –Moodle-sivustolta.
Mikrobiologian peruskurssi (MIKRO200) 5 op 86425
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat sekä opiskelijat, joille kurssi on muutoin osa tutkintoa.
Ajoitus: IV periodi. Suoritetaan 1. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: YKEM010, YKEM020 ja BKEM100 suoritettuna tai samanaikaisesti käytynä.
Tavoite: Opiskelija tunnistaa erilaisten mikrobien rakenteita, osaa kuvailla mikrobien erityisominaisuuksia ja erotella eri mikrobiryhmiä sekä niiden aineenvaihduntaa ja mikrobien hyötykäyttöä ja niiden aiheuttamia ongelmia.
Sisältö: Kurssilla perehdytään mikro-organismien tutkimiseen ja havaitsemiseen sekä niiden evoluutioon ja ekologiaan. Opimme ymmärtämään, miten mikrobit selviävät eri olosuhteissa ja millaista aineenvaihduntaa siihen tarvitaan. Kurssilla tutustutaan erilaisiin mikrobiryhmiin - bakteereihin, arkkeihin, sieniin ja viruksiin sekä tarkastellaan niiden roolia mm. aineiden kierroissa, biotekniikassa ja sairauksien aiheuttajina.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Madigan, Martinko, Dunlap, Clark. 2009. Brock Biology of Microorganisms, 12. painos, Pearson Benjamin Cummings, Pearson Education, Inc.,1061 s., tai kirjan uusin painos. Luentoja täydentää kirja Mikrobiologian perusteita. 2002.
Salkinoja-Salonen, M. (toim.) Soveltavan kemian ja mikrobiologian laitos, Helsingin yliopisto.
Suoritustavat: K46 - H10- R20 - I57. Luentokurssi.
Arviointi: Kirjallinen kuulustelu.
Vastuuhenkilö: Kaarina Sivonen
Lisätiedot: Kurssilla on Moodle-alusta käytössä.
Mikrobiologian perusopintoseminaari (MIKRO210) 5 op 864064
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat.
Ajoitus: II periodi. Suositellaan 2. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: MIKRO200 ja EYT100 tai vastaava johdantojakso.
Tavoite: Opiskelija osaa löytää mikrobiologista tutkimustietoa ja tunnistaa tieteelliset kirjoitukset sekä pystyy kirjoittamaan niistä tiivistelmiä. Hän ymmärtää mikrobien luokittelua ja syventää tietojaan mikrobien aineenvaihdunnasta. Hän osaa alustavasti argumentoida tieteellisesti ja suhteuttaa lukemiaan tieteellisiä tekstejä. Hän osaa luonnehtia tieteellisen tutkimuksen erityispiirteitä ja osaa suullisesti esitellä mikrobiologisia tutkimuksia.
Sisältö: Sähköinen tiedonhaku ja tiedekirjaston ja tietokantojen käyttö (1 op TVT), mikrobiologisen tutkimustiedon muodostuminen tutkimuksesta julkaisuun, tutustuminen mikrobiologiseen tutkimukseen, erilaiset tiedon lähteet ja lähdekritiikki, englanninkielisen kirjallisuuden lukeminen ja ymmärtäminen, suullinen esittäminen ja power point.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Madigan, Martinko, Dunlap, Clark. 2009. Brock Biology of Microorganisms, 12. tai uusin painos, Pearson Benjamin Cummings, Pearson Education, Inc., 1061 s.
Suoritustavat: K20 - H22 – R20 – I70. Seminaarityöskentelyn, ryhmätöiden, kirjallisten kotitehtävien, keskustelun, tiedonhaun ja oman esityksen kautta harjoitellaan eri tiedonlähteiden käyttöä.
Arviointi: Annetut kirjalliset ja suulliset tehtävät hyväksytysti suoritettuina. Aktiivinen osallistuminen.
Vastuuhenkilö: Kristina Lindström.
Lisätiedot: Seminaarilla on Moodle-alusta käytössä.
Mikrobiologian laboratorioharjoitukset (MIKRO220) 5 op 86463
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat sekä opiskelijat, joille kurssi on muutoin osa tutkintoa.
Ajoitus: I, II tai IV periodissa, kolme tai neljä ryhmää. Suoritetaan 2. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: MIKRO200, YKEM010, YKEM020, YKEM101/YKEM102 ja TVT-ajokortti.
Tavoite: Laboratoriokurssin suoritettuaan opiskelija osaa toimia turvallisesti mikrobiologisessa laboratoriossa, ottaa ja käsitellä mikrobeja sisältäviä näytteitä, sekä määrittää mikrobien lukumääriä ja tunnistaa niitä käyttäen mikrobiologisia perustyömenetelmiä.
Opiskelija oppii laatimaan ja ylläpitämään laadukasta laboratoriotyöpäiväkirjaa ja raportoimaan tutkimuksistaan tieteelliseen tyyliin kirjoitetun työselostuksen muodossa.
Sisältö: Kurssilla opetellaan aseptinen ja turvallinen työskentely, sterilointi ja desinfiointi, mikrobien viljely käyttäen omasta näytteestä eristettyä mikrobipuhdasviljelmää, mikroskopointi ja Gram-värjäys, entsymaattiset reaktiot, ravintoalustojen valmistus ja käyttö mikrobien kasvatuksessa,mikrobien tunnistus ja mikrobitiheyden määrittäminen. Tuloksista kirjoitetaan työselostukset itsenäisenä ja
parityöskentelynä.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Työohjemoniste, joka on ostettavissa ennen kurssia Yliopistopainosta.
Suoritustavat: K16 - H48 - R21 - I 50. Laboratoriokurssi, jolla on läsnäolopakko. Kurssilla on ohjattua työskentelyä neljän viikon ajan 4 h päivässä 3 kertaa viikossa joko ma+ke+pe tai ti+to+pe. Vaihtoehtoisia ryhmiä on 3 kpl syyslukukaudella ja 1 ryhmä kevätlukukaudella.
Arviointi: Kirjalliset tehtävät, työselostukset ja laboratoriotyöpäiväkirja Vastuuhenkilö: Taina Lundell
Lisätiedot: Kurssilla on Moodle-alusta käytössä.
Elintarvikemikrobiologia (MIKRO231) 5 op 864065
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat sekä elintarviketieteiden ja -biotekniikan opiskelijat.
Ajoitus: III periodi. Suositellaan suoritettavaksi 2. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: MIKRO200 ja MIKRO220, tai Biotieteiden perusteet I ja II sekä BIOT102.
Tavoite: Opiskelija ymmärtää, mistä mikrobit tulevat elintarvikkeisiin, minkälainen sisäisten ja ulkoisten tekijöiden vaikutus on mikrobien kasvuun, miten estetään mikrobien kasvua elintarvikkeissa, ja miten mikrobeja osoitetaan ja lukumääriä arvioidaan elintarvikkeista.
Opiskelija osaa kuvailla hygienian, omavalvonnan, HACCP:n sekä laadunhallinnan perusteet. Hän osaa selittää pilaantumisprosessin ja eri elintarvikeryhmien pilaantumispiirteitä. Opiskelija on tietoinen vesi- ja elintarvikevälitteisten patogeenisten bakteerien, virusten, homeiden, alkueläimien, heisi- ja sukkulamatojen, levien, syanobakteereiden ja prionien aiheuttamista haitoista ja vaaroista.
Sisältö: Mikrobiekologiaa, elintarvikkeiden sisäiset ja ulkoiset tekijät suhteessa mikrobien kasvuun, teknologiset keinot (pH,
57(290) fermentointi, aW, lämpö, modifioitu ilmakehä, antimikrobiset yhdisteet, säteily, korkeapainekäsittely, ym.) mikrobien toiminnan
estämiseksi elintarvikkeissa, omavalvonta, HACCP, mikrobiologian laatu, elintarvikkeiden pilaantuminen, elintarvike- ja vesivälitteiset patogeenit, sekä vesi elintarvikkeena: juoma- ja talousvedet.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssilla osoitettu kirjallisuus.
Suoritustavat: K42 - H0 - R10 - I81. Luentokurssi.
Arviointi: Kirjallinen kuulustelu.
Vastuuhenkilö: Per Saris
Lisätiedot: Kurssilla on Moodle-alusta käytössä.
Elintarvikemikrobiologian laboratoriotyöt (MIKRO232) 5 op 864067
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat.
Ajoitus: IV periodi. Suositellaan suoritettavaksi 2. tai 3. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: MIKRO200, MIKRO220, YKEM010, YKEM020, YKEM101/YKEM102 ja TVT-ajokortti. MIKRO231 joko suoritettuna tai samanaikaisesti käytynä.
Tavoite: Opiskelija osaa käyttää elintarvikemikrobiologian keskeisiä standardeja ja menetelmiä ja ymmärtää, mitkä ovat elintarvikkeiden ja talousveden laadun ja puhtauden määritelmät. Hän kykenee valitsemaan elintarvikkeiden fermentointiin sopivat menetelmät ja muuttamaan niitä tarpeen mukaan. Lisäksi opiskelija osaa arvioida sisäilman mikrobiologisen laadun sekä raportoida työnsä tuloksista suullisesti ja kirjallisesti tieteellistä tyyliä noudattaen.
Sisältö: Valvontastandardit (juomavesi ja elintarvikkeet), elintarvikkeiden ja veden haitalliset mikrobit ja niiden eristäminen ja tunnistaminen, fermentointi, hygienia, ilman mikrobiologinen laatu, kvantitatiivinen PCR elintarvikenäytteestä. Mikrobiologisten määritysten epävarmuus.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssityömoniste, menetelmästandardeja.
Suoritustavat: K10 - H80 - R10 - I33. Laboratoriokurssi, jolla on läsnäolopakko.
Arviointi: Kirjalliset työselostukset ja suullinen tulosten esittely.
Vastuuhenkilö: Mikrobiologian yliopistonlehtorit
Lisätiedot: Kurssilla on Moodle-alusta käytössä. This course is also available in English to International Master‟s Degree students.
Food Microbiology (MIKRO233) 4 op 864988
Ajoitus: Master studies, 1st year, study periods I-IV.
Tavoite: The student understands how the microbes are distributed into the food chain, the effect of intrinsic and extrinsic factors on microbial growth, how microbes can be inhibited in foods, how microbes are detected and quantified in foods, basics of self control and HACCP, microbial quality and quality control. The student can explain food spoilage processes and recognize the hazards of food and water pathogenic microorganisms and parasites including toxin production (mould, cyanobacterial and algae toxins, biogenic amines and prions).
Sisältö: Ecology of microbes, intrinsic and extrinsic factors of food, technological methods for inhibition of microbes, self control and HACCP, microbiological quality, spoilage of foods, food and waterborne pathogens.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: J.M. Jay et al. Modern Food Microbiology, 7th edition. Springer Science + Business media Inc. 2005, NY, USA. Parts I, II, III, V and VI. Additional material is found on the Moodle platform.
Suoritustavat: Literature examination. Corresponding lectures (MIKRO231 period III) are given in Finnish.
Arviointi: Literature examination. Written examination takes place on general examination dates. Registration through WebOodi.
Vastuuhenkilö: Per Saris
Ympäristömikrobiologia (MIKRO241) 5 op 864068
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat, myös Bio- ja ympäristötieteellisestä tiedekunnasta, sekä ympäristötieteiden opiskelijat.
Ajoitus: I periodi. Suositellaan suoritettavaksi 3. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: MIKRO200, MIKRO210, MIKRO220, YKEM010, YKEM020, BKEM100 ja MAA200.
Tavoite: Kurssin käynyt opiskelija ymmärtää mikrobien osuuden tärkeimpien alkuaineiden kierrossa ja välttämättömyyden kaikkien maapallon ekosysteemien toiminnassa. Opiskelija pystyy arvioimaan ympäristön tilaa mikrobiologisesta näkökulmasta ja hänellä on välineitä suunnitella ympäristön mikrobiologista seurantaa. Hän pystyy myös arvioimaan tutkitun tiedon pohjalta, mitä mikrobistolle tapahtuu ympäristön muutosten seurauksena ja suunnittelemaan toimenpiteitä ympäristön tilan parantamiseksi.
Sisältö: Maa- ja vesiekosysteemien mikrobiekologia ja aineiden kierrot, mikrobi-kasvi -vuorovaikutussuhteet, ympäristön kunnostus ja valvonta, jätevesien käsittely ja vaikutus ympäristöön.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssilla esitetty kirjallisuus.
Suoritustavat: K63 - H0 - R10 - I60. Luennot, ryhmätyöt, keskustelut, esitykset ja kotitehtävät.
Arviointi: Kurssityöskentely, kirjallinen ja suullinen kuulustelu.
Vastuuhenkilö: Sari Timonen
Lisätiedot: Kurssilla on Moodle-alusta käytössä.
Ympäristömikrobiologian laboratoriotyöt (MIKRO242) 5 op 864069
Kohderyhmä: Mikrobiologian pää- ja sivuaineopiskelijat.
Ajoitus: II periodi. Suositellaan suoritettavaksi 3. opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: MIKRO200, MIKRO210, MIKRO220, YKEM010, YKEM020, YKEM101/YKEM102, BKEM100, MAA200, TVT-ajokortti, MIKRO241 suoritettuna tai samanaikaisesti käytynä, tai vastaavat opinnot suoritettuina.
Tavoite: Opiskelija osaa soveltaa mikrobiologisen ekosysteemitutkimuksen keskeisiä menetelmiä sekä raportoida työnsä tuloksista suullisesti ja kirjallisesti hyvää tieteellistä tyyliä noudattaen.
Sisältö: Mikrobibiomassan ja sen aktiivisuuden mittaaminen, biohajoavuuden ja toksisuuden testaaminen, mikrobien prosessit, esim.
entsyymiaktiivisuus. Sisältää omien tulosten käsittelyä tilasto- ja taulukkolaskennan menetelmillä.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Työohjeet, kurssilla esitetty kirjallisuus.
Suoritustavat: Laboratoriokurssi, jolla on läsnäolopakko, maastotyöpäivä ja seminaari.
Arviointi: Työselostukset, seminaariesitys Vastuuhenkilö: Mikrobiologian yliopistonlehtorit
58(290) Lisätiedot: Kurssilla on Moodle-alusta käytössä.
Sienten biologia (MYKO251) 2 op 864084
Kohderyhmä: Mikrobiologian, biotekniikan, maaperä- ja ympäristötieteiden, kasvi- ja metsäpatologian, biotieteiden opiskelijat.
Opintojakso on osa sienitieteen sivuainekokonaisuutta.
Ajoitus: IV periodi. Kandidaatti- ja maisteriopinnoissa.
Edeltävät opinnot: Suosituksena on BKEM100 tai Biotieteiden perusteet I.
Tavoite: Opiskelija tietää miten sienet eroavat muista eliöistä. Hän osaa kuvata sienisolujen ja rihmastojen rakenteita ja ymmärtää niiden toiminnan perusperiaatteet. Osaa käyttää geneettistä, fysiologista ja ekologista tietoa yksinkertaisten pulmien ratkaisemiseen.
Kykenee paikantamaan ja arvioimaan sienten genomitason tietoa. Osaa käyttää eri aihealueiden tietoa erilaisten sieniryhmien määrittelyssä.
Sisältö: Perustiedot sienten evoluutiosta, solubiologiasta, genetiikasta, fysiologiasta, aineenvaihdunnasta, lisääntymisestä ja sopeutumisesta erilaisiin elinympäristöihin.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssilla jaettu kirjallisuus.
Suoritustavat: K11 - H24 - R6 - I12 - 53 Arviointi: Seminaarityöt, kotitehtävät, tentti Vastuuhenkilö: Sari Timonen
Lisätiedot: Kurssi järjestetään parillisina vuosina. Kurssilla on Moodle-alusta käytössä.
Ecosystem Services in Tomorrow’s Agriculture (MENVI Summer course), 6 op 97064
Kohderyhmä: The course is intended for Master's and advanced level students, as well as professionals in agriculture or other related fields.
Ajoitus: August Tavoite:
After completing the course the student should be able to:
- Understand the concept of ecosystem services and recognise a range of such services related to agricultural production
- Recognize currently available agronomic and technological advances which enhance the ecosystem services in agro-ecosystems - Integrate the concept of ecosystem services with the existing legal and economic tools
- Explain the basic principles behind continuous provisioning of multiple ecosystem services in agro-landscapes - Apply ecological principles and agronomic knowledge to practical on-farm solutions
- Improve and develop skills in reflective learning
- Improve and develop skills for working in an intercultural, multilingual and interdisciplinary group.
Sisältö: The course will demonstrate students how natural processes in ecosystems used for agriculture support the continuous provisioning of food and other biomass, contribute to purification of waters and soil, and cultural values. The course will be highly interactive and rich in practical learning. It will be organized around a project for a real case farm. Lectures, interviews with experts, fieldwork and excursions will provide students with the relevant theoretical concepts and practical approaches needed for the project work. The course will also introduce students of different educational cultures to principles and practices of reflective learning.
Suoritustavat: Contact teaching, group work, independent study, seminar, study trips.
Vastuuhenkilö: Irina Herzon, herzon(at)mappi.helsinki.fi
Lisätiedot: The course is a three-week summer school, an academic event organised under the umbrella organisation Helsinki Summer School at the University of Helsinki. More information on admission can be found at www.helsinkisummerschool.fi. Course prerequisites are basic studies in agricultural, environmental, or soil sciences, or other appropriate field. The course has earlier been organized under the course code MIKRO260.
Mikrobiologian katsauksen kirjoittaminen (MIKRO290) 5 op 864063
Kohderyhmä: Sivuaineopiskelijat ja kansainväliset opiskelijat Ajoitus: Mikrobiologian perusopinnoissa.
Edeltävät opinnot: MIKRO200 Tavoite: Katso opintojakso MIKRO210.
Sisältö: Mikrobiologinen essee (5-10 sivua), jossa opiskelija perehtyy mikrobiologiseen ongelmaan ja osoittaa hallitsevansa mikrobiologisen tieteellisen tiedon haun ja mikrobiologiassa käytettävät käsitteet.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Mikrobiologian alan tieteellinen kirjallisuus.
Suoritustavat: I 133.
Vastuuhenkilö: Kristina Lindström
Lisätiedot: Mikrobiologian perusopinnot 25 op sivuaineena suoritettaessa voidaan tällä kurssilla korvata opintojakso MIKRO210. Korvaavuudesta on sovittava vastuuopettajan kanssa etukäteen. This course is also given in English.
Mikrobiologin työhön tutustuminen (MIKRO401) 1 op 864081
Kohderyhmä: Mikrobiologian pääaineopiskelijat.
Ajoitus: I tai II periodi, 2.-3. opintovuosi.
Edeltävät opinnot: EYT100, EYT200, MIKRO200, MIKRO210 ja MIKRO220.
Tavoite: Opintojakson jälkeen opiskelija osaa laatia työnhakukirjeen ja hankkia itsenäisesti tietoa tutkintoonsa soveltuvista työpaikoista sekä tarvittaessa raportoida työharjoittelustaan.
Sisältö: Rekry-palvelun työelämäkoulutukseen osallistuminen, annettujen tehtävien suoritus, osallistumisraportin kirjoitus.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Jaettu tai haettavaksi annettu kirjallinen materiaali.
Suoritustavat: K10- I17.
Arviointi: Osallistuminen, raportit.
Vastuuhenkilö: Taina Lundell
Lisätiedot: Opintojakso voidaan suorittaa joko osallistumalla Helsingin yliopiston Rekry-palvelun järjestämään työelämäkoulutukseen tai vähintään 1 kk:n työharjoitteluna yliopiston ulkopuolella. Jälkimmäisessä tapauksessa kirjoitetaan harjoitteluraportti. Harjoittelusta ja suorituksista on sovittava vastuuopettajan kanssa. Tarkemmat suoritusohjeet löytyvät Mikrobiologian opintoneuvonta –Moodle-alustalta.
59(290)
Kandidaatin kirjatentti (MIKRO450) 10 op 86471
Kohderyhmä: Mikrobiologian kandidaattivaiheen pääaineopiskelijat. Maisteriohjelmissa siltaopintoja tekevät pääaineopiskelijat.
Ajoitus: Kandidaatintutkinnon lopputentti, yleensä 3. opiskeluvuonna
Edeltävät opinnot: MIKRO200, MIKRO210, MIKRO220, MIKRO231, MIKRO241, BKEM100.
Tavoite: Kirjallisen ja suullisen tentin jälkeen opiskelija ymmärtää mikrobien monimuotoisuutta, solubiologiaa, evoluutiota,
aineenvaihduntaa, kasvua ja genetiikkaa. Perustavoite on analysoida mikrobisolujen toimintaa itsenäisinä solueliöinä ja eliöyhteisöissä.
Opiskelija osaa arvioida mikrobien kokonaismerkitystä unohtamatta historiallisia yhteyksiä mikrobiologisen tiedon vaikutuksista ihmisyhteiskuntien kehityksessä ja tulevaisuudessa.
Sisältö: Mikrobien metabolia ja genetiikka, evoluutio, mikrobien monimuotoisuus, mikrobiekologia, immunologia ja mikrobitaudit, mikrobit teollisuudessa ja tutkimuksessa.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Madigan, Martinko, Dunlop, Clark. 2009. Brock Biology of Microorganisms, 12. tai uusin painos, Pearson Benjamin Cummings, Pearson Education, Inc., 1061 s.
Suoritustavat: I 267. Kirjatentti.
Arviointi: Kirjallinen ja suullinen kuulustelu. Kirjallisen kuulustelun voi tehdä kahdessa osassa. Kuulustelutilaisuudet laitoksen ja oppiaineen yleisinä tenttipäivinä. Ilmoittautuminen WebOodiin.
Vastuuhenkilö: Per Saris
Lisätiedot: Suoritettaessa kirjallinen kuulustelu kahdessa osassa ensimmäiseen kuulusteluun luetaan kirjan luvut 1-19 ja toiseen kuulusteluun luvut 20-37 (Brock Biology of Microorganisms, 12. painos). Kirjallisten tenttiosioiden hyväksytyn suorittamisen jälkeen tulee varata vastuuopettajalta aika suulliseen kuulusteluun.
MScFood Microbiology Literature Examination (MIKRO451) 5 op 864994
Kohderyhmä: MScFood students who intend to take the MIKRO510 laboratory course.
Ajoitus: 2nd year of Master‟s studies.
Edeltävät opinnot: MIKRO233 and MIKRO576.
Tavoite: The student understands microbiology as science and its interconnections with other disciplines as well as an overall picture of microbiology in different areas of society.
Sisältö: Microbial metabolism and genetics, evolution, microbial diversity, microbial ecology, immunology, microbes in industry and research.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Madigan, Martinko, Dunlop, Clark (2009) Brock Biology of Microorganisms, 12th edition, chapters: 1, 4, 5, 7-14, 18-19, 21-26, 29-31, in total 453 pages.
Suoritustavat: Self study 150 h. Book examination.
Arviointi: Literature examination. Written examination takes place on general examination dates. Registration through WebOodi.
Vastuuhenkilö: Per Saris
Lisätiedot: This examination must be completed with MIKRO233 and MIKRO575 prior to the commencement of the MIKRO510 laboratory course (a prerequisite for master‟s thesis work in microbiology for the Food Safety track of MScFood).
Kandidaatin seminaari (MIKRO480) 4 op 864076
Kohderyhmä: Mikrobiologian kandidaattivaiheen pääaineopiskelijat.
Ajoitus: III-IV periodi, II periodilla 3 opetuskertaa, 3. opiskeluvuosi.
Edeltävät opinnot: MIKRO200, MIKRO210, MIKRO321, MIKRO241, EYT100, EYT200, TVT-ajokortti.
Tavoite: Opiskelija osaa etsiä tieteellistä tutkimustietoa eri lähteistä sekä arvioida ja käyttää sitä oman kandidaatintutkielmansa laadintaan. Hän syventää mikrobiologian alan tietojaan sekä tieteen ja tutkimuksen eettisten periaatteiden ja toimintatapojen tuntemustaan. Hän kehittää äidinkielensä suullista ja kirjallista osaamistaan.
Sisältö: Kirjaston käyttö ja sähköinen tiedonhaku (1 op TVT), äidinkielen opetus (2 op), mikrobiologian alan tiedon ja tieteellisten käytäntöjen omaksuminen, kandidaatintutkielman aiheen valinta, rungon ja tekstiosion laadinta ja suullinen esittäminen.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Erilaisia mikrobiologian tiedon lähteitä.
Suoritustavat: K20 - H37 - R10 - I40. Seminaari.
Arviointi: Osallistuminen, annetut tehtävät, tekstiosio kandidaatin tutkielman aiheesta.
Vastuuhenkilö: Mikrobiologian yliopistonlehtorit.
Lisätiedot: Kandidaatin seminaarilla on Moodle-alusta käytössä.
Kandidaatin tutkielma (MIKRO490) 6 op 864021
Kohderyhmä: Mikrobiologian pääaineopiskelijat.
Ajoitus: 3. opiskeluvuosi
Edeltävät opinnot: Mikrobiologian perusopinnot (25 op) suoritettu. MIKRO480 samanaikaisesti.
Tavoite: Opiskelija osaa kirjoittaa mikrobiologian tieteenalalta hyvää äidinkielen taitoa osoittavan review-tyyppisen katsauksen oikeata tieteellistä kirjoitustyyliä ja alkuperäistietojen viittaustapaa noudattaen. Hän osaa syventää, yhdistää ja analysoida löytämiään lähdetietoja sekä tehdä tausta- ja tutkimustiedoista itsenäisiä johtopäätöksiä.
Sisältö: Kandidaatin kirjallisen tutkielman itsenäinen laatiminen ja kirjoittaminen osallistumalla seminaarityöskentelyyn MIKRO480 Kandidaatin seminaarissa.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Erilaisia mikrobiologian tiedon lähteitä. Mikrobiologian alan tieteellinen kirjallisuus.
Suoritustavat: I 160. Itsenäistä työskentelyä ja tiedonhakua. Kirjoitustyötä ohjaa alan tutkija tai opettaja.
Arviointi: Kandidaatintutkielman tarkastuksessa ja arvostelussa käytetään Maatalous-metsätieteellisen tiedekunnan arviointimatriisia.
Vastuuhenkilö: Per Saris ja Kaarina Sivonen
Yhteydet muihin opintojaksoihin: MIKRO480 samanaikaisesti.
Lisätiedot: Kandidaatintutkielmaan liittyy kirjallinen kypsyyskoe, joka vaaditaan kandidaatintutkintoon. Kypsyyskokeeseen ilmoittaudutaan MIKRO480 vastuuopettajalle, kun kandidaatintutkielma palautetaan arvioitavaksi.
Maisterin opintojen HOPS (MIKRO501) 1 op 864077