117(290) Vastuuhenkilö: Juha Helenius
Wildlife in the Farming Environment (AEKO505) 5 op (a 2-op option is available, contact the teacher) 812096
Target group: students in crop production and animal husbandry, forest ecology, and population ecology.
Timing: Autumn term, period I, recommended in 3rd or 4th year of the BSc studies
Preceding studies: KTB201 Agroecology or KTB204 Ekologian perusteet maataloustieteiden opiskelijoille; other comparable studies in plant production or agricultural sciences or ecology.
Objective: After completing the course the successful student will have sound understanding of associated (non-productive) biodiversity in agricultural ecosystems, it‟s interaction with the farming practices, and of the basic principles and approaches of conservation in agroecosystems. On a practical level, the student will gain skills to apply conservation planning in real farm conditions.
Contents: The specific focus is on non-productive biodiversity, and we will proceed all the way from measuring it in field to the on-farm planning. With assistance of experts in fields of research, advisory and nature management, we will explore the variety of biodiversity of a farm, effects of farming practices, and basic principles and motivations for nature conservation; learn of major legal and other conservation tools in the EU relevant to a farmer; go through the process of management planning and search for available advisory information. The course will culminate in developing a management plan for a real farm.
Teaching and learning methods: Interactive lectures, weekly work in field, a study visit, individual and group work, and a final seminar.
Study materials and literature: Will be provided during the course.
Completion: Lectures or alternative assignments, two brief essays related to own country, individual exercise, group presentation, and a course report. Contact the teacher about a 2-op option tailored to your background.
Evaluation: Based on the assignments as above. Graded 0-5.
Responsible person: Juha Helenius Other information: Quota 20 students
Työskentely tutkimusryhmässä (AEKO506) 5-10 op 81260
Kohderyhmä: Pääaineopiskelijat
Ajoitus: Sopimuksen mukaan, ennen pro gradu -työtä Edeltävät opinnot: Kandidaatin tutkinto tai vastaavat tiedot
Tavoite: Opintojakson suoritettuaan opiskelija osaa itsenäisen tutkimusryhmätyöskentelyn ja tutkimustulosten raportoinnin perusperiaatteet
Sisältö: Kokopäiväinen 1-2 kk:n harjoittelujakso tutkimusryhmässä. Opiskelijan perehtyy pienimuotoisen projektin avulla tutkimusryhmän työskentelyyn opettajan johdolla. Harjoittelun aikana opiskelija tutustuu tutkimusongelmaan lukemalla hänelle annettavat artikkelit ja keskustelemalla ko. tutkimusongelmasta. Harjoittelujakson lopussa opiskelija kirjoittaa työstään lyhyen raportin, joka jätetään ohjaajalle yhdessä työkirjan kanssa.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Projektiin liittyvää kirjallisuutta
Suoritustavat: Tutkimusryhmätyöskentely, raportin ja työkirjan kirjoittaminen Arviointi: Hyväksytty raportti ja työkirja. 0-5
Vastuuhenkilö: Juha Helenius
Postgraduate studies in agroecology (AEKO601) 5-10 cp 812094
Target group: PhD students in agroecology.
Timing: After completion of the MSc degree.
Preceding studies: MSc degree in agroecology, or equivalent studies
Objective: In these courses, the student has deepened her/his methodological skills in the research area.
Contents: The contents vary depending on the course or study activity in question.
Completion: Usually a PhD course includes pre and post course literature assignments, an intensive course week of lectures, workshops and excursions. Activities and assignments are variable depending on the course.
Evaluation: Pass / Fail
Responsible person: Juha Helenius takaisin ylös
118(290) Tutkintovaatimukset 2011-2014
MAISTERIN TUTKINTO, 120 op
YLEISOPINNOT, 21 op opintopisteet ajoitus
KTB411 Maisterin tutkinnon henkilökohtainen opintosuunnitelma 1 4
Y131A Tilastollisia malleja 1 5 4
KTB407 Experimental design and analysis 5 4
KTB406 Scientific writing 5 5
Seuraavista vähintään 5 op:
Y100 Matematiikka 1 5 4
Y132 Tilastollisia malleja 2 5 4–5
Y136 Tilastollisten tietojenkäsittelyohjelmistojen sovellukset 5 4–5
KTB401 Crop physiology 3 4–5
KTB403 Stress physiology 3 4–5
KTB405 Crop physiology practicals 5 4–5
BIOT2001 Geenitekniikan perusteet1 2 4
BIOT2011 Geenitekniikan harjoitustyöt1 3 4
PÄÄAINEOPINNOT, 72-80 op
Syventävät opinnot, 72-80 op
JAL401 Selection breeding and experimental designs 5 4–5
JAL504 Breeding of agricultural and horticultural crop plants 5 4–5
JAL502 Kasvin- ja metsänjalostuksen kirjallisuus 10 5
KTB301 Erikoisharjoittelu 2 3–4
KTB501 Kasvintuotantotieteiden seminaarit 3 4–5
JAL503 Maisterintutkielma (pro gradu) 40 5
Kypsyysnäyte 0 5
Seuraavista 7-15 op:
JAL402 Conservation of plant genetic resources 5 4–5
JAL403 Molecular methods in applied plant genetics 5 4–5
JAL505 Forest tree breeding 5 4–5
JAL506 Jalostuksen muut opinnot 3-5 5
KBIOT3001 Plant biotechnology and molecular biology1 5 4–5
KBIOT301 Laboratory course in plant biotechnology 5 4–5
KBIOT401 Laboratory course in plant molecular biology 5 4–5
MPAT221 Advanced forest mycology and pathology 8 4–5
KPAT501 Plant-microbe interactions and molecular defence of plants 10 4–5
PTARH303 Postharvest physiology and technology 5 4
PTARH402 Photobiology 5 4–5
Muita syventäviä kursseja sopimuksen mukaan
KIELIOPINNOT SEKÄ TIETO- JA VIESTINTÄTEKNIIKAN (TVT) OPINNOT
Maisterin tutkinnossa 1 op TVT-opintoja on integroitu opintojaksoon KTB501.
MUUT OPINNOT, 19-27 op
JAL2011 Populaatio- ja kvantitatiivinen genetiikka1 5 2
KBIOT2001 Kasvibiokemian ja solubiologian luennot1 3 2
Muita pääainetta tukevia opintoja, joista sovitaan professorin ja/tai opintoneuvojan kanssa HOPSin yhteydessä.
MAISTERIN TUTKINTO YHTEENSÄ 120
1Suositellaan suoritettavaksi kasvintuotannon biologian kandidaatin tutkinnossa.
Mikäli opiskelija on suorittanut maisterin tutkintoon kuuluvia pakollisia kursseja muissa opinnoissaan, tulee hänen opiskella vastaava opintopistemäärä erikseen sovittavia yleis- ja syventäviä opintoja.
takaisin ylös
119(290) Opintokokonaisuudet pääaineopiskelijoille
81047 Kasvinjalostuksen syventävät opinnot Opintokokonaisuudet sivuaineopiskelijoille
Kasvinjalostuksen opinnot sivuaineopiskelijoille 25 op Tunniste: 81048
Esivaatimuksena genetiikan perusteet (52081) tai vastaavat tiedot KTB220/KBIOT220 Kasvin- ja metsänjalostus, 5 op
JAL201 Populaatio- ja kvantitatiivinen genetiikka, 5 op KBIOT200 Kasvibiokemian ja solubiologian luennot, 5 op Seuraavista opinnoista 10 op:
JAL401 Selection breeding and experimental designs, 5 op JAL402 Conservation of plant genetic resources, 5 op JAL403 Molecular methods in applied plant genetics, 5 op JAL504 Breeding of agricultural and horticultural crop plants, 5 op JAL505 Forest tree breeding, 5 op
KBIOT300 Plant biotechnology and molecular biology, 5 op KBIOT301 Laboratory course in plant biotechnology, 5 op KBIOT401 Laboratory course in plant molecular biology, 5 op
Opintojaksot 2011-2014 (sivut 34-37) Opetustiedot WebOodissa
Kasvibiokemian ja solubiologian luennot (KBIOT200) 3 op 81084
Ajoitus: SL, II periodi, suositellaan suoritettavaksi toisena opiskeluvuonna Edeltävät opinnot: Biotieteiden perusteet I ja II
Tavoite: Opiskelija oppii kasvibiokemian ja solubiologian perusperiaatteet.
Sisältö: Luennoilla käsitellään kasvisolun rakenne ja kasvisolun prosessien biokemia, fysiologia ja säätely sekä geeni- että biokemiallisella tasolla. Luennot sisältävät mm. kloroplastit ja fotosynteesin valo- ja pimeäreaktiot, C4 ja CAM fotosynteesi, tuman ja kloroplastin genomien kommunikaatio, kasvien hiilimetabolia (sisältäen soluseinän rakenteen ja synteesin), typpimetabolia ja lipidimetabolia sekä henglantilantiitys ja kasvimitokondrioiden erityispiirteet.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Luennoitsijan jakama luentomateriaali. Kirjallisuus: Buchanan, B.B, Gruissem, W & Jones, R.L, 2002:
Biochemistry and Molecular Biology of Plants. 1408 sivua (soveltuvin osin).
Suoritustavat: Luentokurssi Arviointi: Kirjallinen tentti
Vastuuhenkilö: Prof. Jaakko Kangasjärvi (Bio- ja ympäristötieteellinen tiedekunta)
Lisätiedot: Kurssi järjestetään yhteistyönä maatalous-metsätieteellisen ja bio- ja ympäristötieteellisen tiedekunnan kanssa.
Populaatio- ja kvantitatiivinen genetiikka (JAL201) 3-5 op 81038
Ajoitus: SL, II periodi, suositellaan suoritettavaksi toisena opiskeluvuotena.
Edeltävät opinnot: Suosituksena biotieteiden perusteet I ja II (529001 ja 529002) tai genetiikan perusteet (52081).
Tavoite: Opiskelija ymmärtää populaatio- ja kvantitatiivisen genetiikan perusteorian ja osaa soveltaa oppimaansa tietoa jalostuksen, perinnöllisyystieteen ja evoluutiobiologian kysymyksissä.
Sisältö: Teoreettisen ja molekulaarisen populaatiogenetiikan sekä kvantitatiivisen genetiikan perusteet. Perehtymistä populaatioiden geneettiseen rakenteeseen vaikuttaviin tekijöihin, geneettiseen muunteluun ja käytettäviin tutkimusmenetelmiin. Laskuharjoituksia ja tieteelliseen kirjallisuuteen tutustumista.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Kurssilla osoitettava materiaali.
Suoritustavat: Luennot ja harjoitustehtävät.
Arviointi: Kirjallinen tentti 50% ja harjoitustyöt 50%. Arvosteluasteikko 0-5.
Vastuuhenkilö: Helena Korpelainen
Lisätiedot: Kurssi voidaan suorittaa joko 3 tai 5 op:n mittaisena. Alkuosa kurssia on kaikille yhteinen, mutta kvantitatiivista genetiikkaa syvällisemmin käsittelevä loppuosa on tarkoitettu 5 op:n kurssin suorittajille. Tilastotieteen perusteiden hallinta on suositeltavaa.
Plant biotechnology and molecular biology (KBIOT300) 5 cp 81085
Timing: Spring term, period III
Preceding studies: Basic studies in plant cell biology, eg.KBIOT200 Plant Biochemistry and Cell Biology
Objective: The student will become acquainted with the basics of plant biotechnology and molecular biology, and related legislation and risk assessment.
Contents: Lecture topics: Molecular biology of agrobacterium-mediated gene transfer; gene transfer methods and vectors for plant transformation; plant genome structures; molecular biology of light perception and signal transduction in plants; pathways to plant secondary metabolites; molecular basis of vegetative-reproductive transitions and flower development; molecular basis of abiotic and biotic stress responses in plants; applications in plant biotechnology; forest biotechnology; basics of legislation and risk assessment in plant biotechnology
Study materials and literature: Lecture material + additional reading given by the lecturers. Literature: Buchanan, B.B, Gruissem, W &
Jones, R.L, 2002: Biochemistry and Molecular Biology of Plants. 1408 pages (relevant parts).
Completion: Lecture course
Evaluation: Short written assignment, final examination
Responsible person: Prof. Teemu Teeri (Faculty of Agriculture and Forestry), Doc. Pekka Heino and Prof. Jaakko Kangasjärvi (Faculty of Biological and Environmental Sciences)
120(290) Other information: The course is given jointly by the Faculty of Agriculture and Forestry and the Faculty of Biological and
Environmental Sciences
Laboratory course in plant biotechnology (KBIOT301) 5 cp 81028
Timing: Spring term, period III
Preceding studies: KBIOT300 Plant biotechnology and molecular biology
Objective: The student will become acquainted with the basic techniques in plant cell culture and gene transfer.
Contents: The laboratory practicals include relevant techniques in plant cell culture (callus and suspension cultures, haploid cultures, protoplast isolation and micropropagation) as well as techniques related to plant gene transfer methods (agrobacterium-mediated, particle bombardment, electroporation) and assays for gene expression (reporter genes encoding GUS, LUC, GFP)
Study materials and literature: Course manual Completion: Laboratory course
Evaluation: Laboratory report
Responsible person: Prof. Teemu Teeri (Faculty of Agriculture and Forestry) and University lecturer (Faculty of Biological and Environmental Sciences)
Other information: The course is given jointly by the Faculty of Agriculture and Forestry and the Faculty of Biological and Environmental Sciences
Laboratory course in plant molecular biology (KBIOT401) 5 cp 812010
Timing: Spring term, period III, in even years
Preceding studies: BIOT200, BIOT201, KBIOT200 and KBIOT300
Objective: The student will become acquainted with some key techniques and applications in plant molecular biology and genome-wide analysis.
Contents: Construction of cDNA libraries; Basics of sequence analysis; Use of microarrays for analysis of gene expression and pathogen diagnostics; Data analysis by means of bioinformatics; Analysis of gene expression using RT-PCR
Study materials and literature: Course manual Completion: Laboratory course
Evaluation: Laboratory report
Responsible person: Prof. Teemu Teeri and Prof Jari Valkonen Other information: Priority for advanced level students.
Selection breeding and experimental designs (JAL401) 5 cp 81039
Timing: Spring term, period III, in even years. Recommended to be taken during the fourth or fifth year of studies.
Objective: The student will become acquainted with the process of selection breeding and how to plan experiments in plant breeding and forest tree breeding.
Contents: The role of genotype, environment, G*E interaction and random effects in determining variation in plants. The structure of breeding trials to separate genetic and environmental effects. Applications of selection work.
Study materials and literature: Relevant literature will be indicated during the course.
Completion: Lectures and presentations.
Evaluation: Examination 70% and presentation 30%. Scale 0-5.
Responsible person: Teemu Teeri
Conservation of plant genetic resources (JAL402) 5 cp 81041
Timing: Spring term, period IV, in even years. Recommended to be taken during the fourth of fifth year of studies.
Objective: The student will become acquainted with the importance of genetic variation and plant genetic resources, and will know how to assess and conserve genetic resources.
Contents: The nature of biological diversity, applications of ecological genetics to plant breeding, practical management of germplasm.
Presentations by students.
Study materials and literature: Relevant literature will be indicated during the course Completion: Lectures, study diary and presentations.
Evaluation: Study diary 70% and presentation 30%. Scale 0-5.
Responsible person: Helena Korpelainen
Molecular methods in applied plant genetics (JAL403/KBIOT403) 5 cp 81037
Timing: Autumn term, period I, in even years. Recommended to be taken during the fourth or fifth year of studies.
Objective: The student will become acquainted with a range of molecular applications available, and will understand their principles and the methodologies used.
Contents: Recent advances in the use of molecular methods in plant and forest tree breeding. Marker-assisted selection, genetic transformation and genomics approaches are discussed in detail. Case studies prepared and
presented by the students.
Study materials and literature: Relevant literature will be indicated during the course.
Completion: Lectures, case studies.
Evaluation: Examination, case studies. Scale 0-5.
Responsible person: Teemu Teeri
Kasvin- ja metsänjalostuksen kirjallisuus (JAL502) 10 op 81043
Ajoitus: Suositellaan suoritettavaksi viidentenä opiskeluvuonna
Tavoite: Opiskelija ymmärtää kasvin- ja metsänjalostuksen periaatteet, geneettisen taustan ja tuntee alan sovellutuksia.
Sisältö: Kasvin- ja metsänjalostuksen teoreettinen perusta ja sovellutukset.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Valitaan seuraavista teoksista joko A- tai B-kokonaisuus: • (A) Maatalous- ja puutarhakasvien
121(290) kokonaisuus • 1) Falconer, D.S. and Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics. Longman, 4th Ed. • 2) Smart, J. and Simmonds, N.W. (Eds.) 1995. Evolution of crop plants. Longman. • 3) Erikoisteos sopimuksen mukaan. • (B) Metsäpuiden jalostus • 1) Falconer, D.S. and Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics. Longman, 4th Ed. • 2) Fins, L. et al. (Eds.) 1992.
Handbook of quantitative forest tree improvement. Kluwer Academic Publishers. • 3) Erikoisteos sopimuksen mukaan.
Suoritustavat: Itsenäinen työskentely Itsenäinen työskentely Arviointi: Kirjallinen tentti. Arvosteluasteikko 0-5.
Vastuuhenkilö: Teemu Teeri
Lisätiedot: Tentin voi suorittaa yhdessä tai kahdessa osassa.
Maisterin tutkielma (pro gradu) (JAL503) 40 op 81052
Ajoitus: Suositellaan suoritettavaksi viidentenä opiskeluvuonna.
Tavoite: Tutkielman tehtyään opiskelija tuntee ja osaa soveltaa tieteellisen tutkimuksen prosessiin kuuluvia työtapoja, osaa
prosessikirjoittamisen, osaa asettaa tutkimuskysymyksiä, löytää ja koostaa aiempaa tutkimustietoa, analysoida tutkimusaineistoa sekä tulkita ja raportoida tulokset.
Sisältö: Opiskelija syventyy tutkimuskysymykseen, ratkaisee kysymyksen tarkoituksenmukaisia metodeja käyttäen, tulkitsee saatuja tuloksia alan tieteelliseen kirjallisuuteen nojaten sekä esittää tutkimustulokset kielellisesti viimeistellyssä muodossa kirjallisesti.
Suoritustavat: Itsenäinen työskentely, kirjoitusprosessi, gradupiiri.
Arviointi: Arvosana perustuu opiskelijan omaan panokseen tutkimusta suunniteltaessa ja toteutettaessa sekä kirjalliseen tutkimusraporttiin.
Vastuuhenkilö: Teemu Teeri
Breeding of agricultural and horticultural crop plants (JAL504) 5 cp 81045
Timing: Autumn term, period I, in neven years. Recommended to be taken during the fourth or fifth year of studies.
Objective: The student will become acquainted with the practical breeding of agricultural and horticultural crop plants.
Contents: Introduction to the practical breeding of agricultural and horticultural plants. Lectures by expert breeders. Presentations by students.
Study materials and literature: Relevant literature will be indicated during the course.
Completion: Lectures and presentations
Evaluation: Examination (70 %) and presentation (30 %). Scale 0-5.
Responsible person: Teemu Teeri
Forest tree breeding (JAL505) 5 cp / 3 cu 81100
Timing: Autumn term, period I, in even years. Recommended to be taken during the fourth or fifth year of studies.
Objective: The student will become acquainted with modern theories and practices in forest tree breeding.
Contents: Recent results and theories concerning the physiological basis and restrictions of yield production implications for breeding.
Patterns of adaptation and variation in forest trees with a special reference to northern environments.
Study materials and literature: Relevant literature will be indicated during the course.
Completion: Lectures.
Evaluation: Examination. Scale 0-5.
Responsible person: Pertti Pulkkinen
Jalostuksen muut opinnot (JAL506) 2-5 op 81001
Sisältö: Muista kasvinjalostuksen ja metsänjalostuksen opinnoista (esim. yksittäiset luentosarjat, opinnot ulkomailla) voidaan antaa suoritusmerkintä.
Suoritustavat: Kokonaisuuden hyväksymisestä ja opintopistemäärästä tulee neuvotella professorin kanssa ennen kokonaisuuden suorittamista.
Vastuuhenkilö: Teemu Teeri
Työskentely tutkimusryhmässä (JAL507) 5-10 op 81268
Kohderyhmä: Pääaineopiskelijat
Ajoitus: Sopimuksen mukaan, ennen pro gradu -työtä Edeltävät opinnot: Kandidaatin tutkinto tai vastaavat tiedot
Tavoite: Opintojakson suoritettuaan opiskelija osaa itsenäisen tutkimusryhmätyöskentelyn ja tutkimustulosten raportoinnin perusperiaatteet
Sisältö: Kokopäiväinen 1-2 kk:n harjoittelujakso tutkimusryhmässä. Opiskelijan perehtyy pienimuotoisen projektin avulla tutkimusryhmän työskentelyyn opettajan johdolla. Harjoittelun aikana opiskelija tutustuu tutkimusongelmaan lukemalla hänelle annettavat artikkelit ja keskustelemalla ko. tutkimusongelmasta. Harjoittelujakson lopussa opiskelija kirjoittaa työstään lyhyen raportin, joka jätetään ohjaajalle yhdessä työkirjan kanssa.
Oppimateriaali ja kirjallisuus: Projektiin liittyvää kirjallisuutta
Suoritustavat: Tutkimusryhmätyöskentely, raportin ja työkirjan kirjoittaminen Arviointi: Hyväksytty raportti ja työkirja. 0-5
Vastuuhenkilö: Teemu Teeri
Nordic post graduate (NOVA) course in plant breeding (JAL602) 5 op 81003
Timing: Recommended to be taken during postgraduate studies.
Objective: The student will become acquainted with modern theories and practices in plant breeding, and will meet international students and teachers in plant breeding.
Contents: Determined separately for each course. 2011: Adaptation to changing climate (Iceland), 2012: Pre-breeding (Sweden), 2013:
Breeding for resistance (Norway), 2014: Genomics and plant breeding (Finland) Study materials and literature: Relevant literature will be indicated during the course.
122(290) Completion: Lectures and presentations.
Evaluation: Determined separately for each course.
Responsible person: Teemu Teeri
Other information: The course will be organized each time in a different Nordic country.
Kasvinjalostuksen jatko-opinnot (JAL601) 5-10 cp 81050
Target group: PhD students in plant breeding and biotechnology Timing: After completion of the MSc degree.
Preceding studies: MSc degree in plant breeding, or equivalent studies
Objective: In these courses, the student has deepened her/his skills in the research area.
Contents: The contents vary depending on the course or study activity in question.
Completion: Usually a PhD course includes pre and post course literature assignments, an intensive course week of lectures, workshops and excursions. Activities and assignments are variable depending on the course.
Evaluation: Pass / Fail
Responsible person: Teemu Teeri takaisin ylös